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簡要描述:RhizoView是一款用于洗根后的專業(yè)根系分析系統(tǒng),可以分析根系長度、直徑、面積、體積、根尖記數(shù)等,功能強大,操作簡單,軟件可分析植物根系的形態(tài),色彩、分級伸展分析及根系的整體結(jié)構(gòu)分布等等。
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詳細介紹
一、 用途:
RhizoView是一款用于洗根后的專業(yè)根系分析系統(tǒng),可以分析根系長度、直徑、面積、體積、根尖記數(shù)等,功能強大,操作簡單,軟件可分析植物根系的形態(tài),色彩、分級伸展分析及根系的整體結(jié)構(gòu)分布等等。廣泛應(yīng)用于根系形態(tài)和構(gòu)造研究。
二、 原理:
RhizoView洗根測量系統(tǒng)可以通過掃描和攝像兩種方式獲取高分辨率植物根系彩色圖像或黑白圖像,針對獲取的圖像,利用插入解密的專業(yè)根系分析軟件讀取TIFF,JPEG標準格式的圖像,同時配合針對圖像獲取系統(tǒng)配置的校準文件,對獲得的高質(zhì)量根系圖像進行分析。
采用非統(tǒng)計學(xué)方法測量計算出交叉重疊部分根系長度、直徑、面積、體積、根尖等基本的形態(tài)學(xué)參數(shù);利用軟件的色彩等級分析功能,還可以對根系顏色進行分析,從而進行根系存活數(shù)量、根系生長和營養(yǎng)狀況等方面研究;
利用軟件的高級分析功能,還可以對完整的植物根系圖像進行根系連接分析(研究根系分支角度、連通性等形態(tài)特征)、根系拓撲分析(研究根系連接數(shù)量、路徑長度)和根系分級伸展分析(記錄根系整體等級分布情況)。從而滿足研究者針對植物根系不同類別和層次的研究。
三、 組成:
1、 圖像獲取系統(tǒng):
? 根系掃描系統(tǒng):在掃描面板下方和上蓋中安裝有專業(yè)的雙光源照明系統(tǒng),并且在掃面板上預(yù)留了雙光源校準區(qū)域。此外,還配備有專用、高透明度根系放置盤。掃描時,掃面板下的光源和上蓋板中的光源同時掃過高透明度根盤中的根系樣品,這樣可以避免根系掃描時容易產(chǎn)生的陰影和不均勻等現(xiàn)象的影響,有效地保證了獲取的圖像質(zhì)量。
? 根系攝像系統(tǒng):高速高拍,可做裁減,旋轉(zhuǎn),放大等處理,比掃描方式快。達到300-600的DPI分辨率。
2、 根系分析系統(tǒng):基本版 /標準版 /專業(yè)版/擬南芥版分析軟件
3、 說明書
4、 電腦 (用戶自備)
掃描系統(tǒng)類型及區(qū)別見下表:
技術(shù)參數(shù) | RhizoView掃描儀(A4尺寸) | RhizoView掃描儀(A3尺寸) |
描述 | 高質(zhì)量高速掃描儀 | 多功能、高速的掃描面積大的掃描儀 |
可否在野外使用 | N | N |
是否需要電腦操作 | Y | Y |
光學(xué)分辨率 | 4800×9600dpi | 4800×9600dpi |
掃描速度 | <6秒 | <6秒 |
掃描面積cm | 反射稿:215.9×355.6mm | 反射稿:304.8×431.8mm |
輸出格式 | JPEG,TIFF,PDF,BMP等 | TIF,BMP,EPS,JPG,PSD,PDF,SCT |
色彩位數(shù) | 彩色:48位,灰階:16位 | 彩色:48位,灰階:16位 |
供電 | 100-240V(±10%),50/60Hz | 100-240V(±10%),50/60Hz |
攝像系統(tǒng):
光學(xué)元件:2000萬高清CMOS鏡頭
攝像面積:A3幅面
攝像速度:僅需1s
圖像色彩:24位彩色
圖像格式:JPG、TIFF、BMP、PDF
對焦方式:自動對焦
接口類型:USB2.0電腦接口,即插即用
供電:100-240V(±10%),50/60Hz
四、 根系分析軟件技術(shù)指標:
測量參數(shù) | WinRHIZO軟件版本 | |||
整體參數(shù) | 基本版 | 標準版 | 專業(yè)版 | 擬南芥版* |
總長 | Yes | Yes | Yes | Yes |
平均直徑 | Yes | Yes | Yes | Yes |
總面積 | Yes | Yes | Yes | Yes |
總體積 | Yes | Yes | Yes | Yes |
根尖、分叉和交疊計數(shù) | Yes | Yes | Yes | Yes |
根直徑等級分布參數(shù) | ||||
長度 | No | Yes | Yes | Yes |
面積 | No | Yes | Yes | Yes |
體積 | No | Yes | Yes | Yes |
根尖計數(shù) | No | Yes | Yes | Yes |
其他功能 | ||||
可以選擇用戶定義的矩形區(qū)域進行分析或從中排除 | Yes | Yes | Yes | Yes |
可以選擇用戶定義的圓形和不規(guī)則形狀區(qū)域進行分析或從中排除 | Yes | Yes | Yes | |
圖像編輯以去除偽影或圖像缺陷。 您可以選擇和編輯圖像中存在的任何顏色或定義您自己的顏色。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
交互式或批量(無操作員監(jiān)督)分析。 注意:并非所有分析都可以批量完成。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
可以打印帶有或不帶有分析標記的圖像并將其保存到文件中。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
在某些情況下,可以從分析中去除碎片。 當它們不與根接觸時,可以根據(jù)它們的面積(任何小于指面積的東西都被視為碎片)或它們的長寬比(碎片往往是圓形的,而根被拉長)過濾掉它們。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
碎片也可以根據(jù)它們的顏色過濾掉。 | Yes | Yes | ||
附帶有大量插圖的印刷版和 pdf 彩色手冊。 | Yes | Yes | Yes | Yes |
專業(yè)版還具備如下功能特征:
1、根系顏色分析:根的長度、面積、體積、根尖計數(shù)、根系存活數(shù)量等研究
(對根系或者根系附著菌種顏色進行分類,如健康根、淺程度受害根、重程度受害根等,軟件可計算每種顏色根系的總長、總表面積、總體積、總根尖數(shù)量;每種顏色根系的平均長度、平均表面積、平均直徑等)
2、根系連接(link)分析:用于根系分支角度、連通性等形態(tài)研究
(與拓撲和發(fā)育分析最大的區(qū)別是,link分析可以針對非完整根系!軟件給出的結(jié)果有分析對象的根系平均直徑、平均長度、平均表面積、每個分叉角度的平均值;分叉的總數(shù)量;每個分叉的長度、表面積、平均直徑、角度、級別等)
3、根系拓撲(Topology)分析:連接數(shù)量、外部路徑長度、高度、幅度、路徑長度、結(jié)構(gòu)化連接等研究(需要根系完整)
(必須是要完整的根系掃描圖像。軟件可計算主根的長度、所有次級根的總長度、平均長度、平均直徑、平均表面積;每一級分叉的下級總分叉數(shù)量;每一級分叉的總數(shù)量等)
4、根系發(fā)育(Development)分析:記錄根系整體等級分布情況(需要根系完整)
(必須是要完整的根系掃描圖像。是拓撲分析的延伸分析。軟件可計算每一個分級根系總長、總表面積,平均長度、平均直徑、平均表面積、分級數(shù)量和分級順序等)
* 擬南芥版具有專業(yè)版所有功能,另外還可針對擬南芥類植物的細小、交叉根系進行測量
五、 產(chǎn)地:中國
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